董氏奇穴是一種療效高，應用容易的針灸之學。大致有下列幾項：一、穴位分佈有一定脈絡可循，二、穴位命名易於瞭解穴性及實用，三、董氏針法不拘補瀉，操作簡易而療效更著，四、董師之治療注重五行及髒象學說，五、董師善於用針刺調理脾胃，六、董師善用棱針刺血治療重病，七、董師注重時間節令與針刺之配合，以提高療效，八、董師執常通變，對於十四經穴尤其精通熟稔。
事實上，董氏奇穴仍有許多精彩高深的內涵，這需要使用者自己去深入鑽研，長久玩味，方能領悟體會，在拙著《針灸經緯》的許多章節中，可以尋出脈絡並得到印證。這裡我再次簡單的補充幾點初談董氏學術思想未及提出的幾點特色如後：
—、針刺重視深淺
針刺的深淺關乎療效極大，古書中不乏記載，董氏奇穴中亦經常提及深淺不同的主治有別，例如：大間及小間穴之手術部份指出：『五分針，正下一分治心臟，二至二點五分爲肺分支神經』。地士穴之手術：『針深一寸治氣喘、感冒、頭痛及腎虧。針深一寸五分治心臟病』。地宗穴之手術：『針深一寸治輕病，針深二寸治重病』。這些隻是列舉其一以示全部。可以說董氏奇穴全部穴位，無不貫徹深淺之理。
董師用穴之深淺大緻依循下列幾項原則。
(一)根據病位：一般病在表、病在肌膚宜淺刺；病在骨、病在臟腑宜深刺。有時治外感表症常在背部大椎、肺俞、膏肓點刺出血即爲淺刺之例。同一穴位之深淺主治亦有別，在前述之大小間、地士，均巳舉例說明，其要旨爲治近宜淺，治遠宜深。又如最常用之足三裡穴，董師常說：針五分一寸治腿部病，針寸半二寸治腸胃病，治心臟病、氣喘病至少宜二寸以上，頭面病則宜二寸半以上，臨床應用確有至理。
(二)根據病性：一般熱症，虛症宜淺刺：寒症、實證宜深刺：新病宜刺淺，久病宜刺深。董師治療較輕較短之病，常以手指顏面較淺部位之穴道針刺；對久病重病則以小腿大腿部位較深之穴位為主；熱病在較淺穴位(背部)及井穴點刺，寒症久病則在腿部、肘部血管或肌肉較厚部位深刺久留或點刺。
(三)根據四時節令：一般春夏宜刺淺，秋冬宜刺深，董師治療疾病不隻遵行春夏刺淺，秋冬刺深之理，在選穴處治方面亦有不同，充分體現了董師對時間治療學的認識。
(四)根據體質：一般肥胖、強壯、肌肉發達者宜刺深；削瘦、虛弱、肌肉脆薄及嬰兒宜刺淺，董師亦遵循此原則進針，對體力勞動者進針較腦力勞動者通常稍深。
(五)根據穴位：董氏奇穴用穴多以四肢爲主，肥厚部份可稍深，其餘部份宜稍淺。穴分天地人三部，局部刺淺，再遠入中，最遠入深。軀幹胸背概以棱針點刺爲主，頭面部穴位多以淺針直刺或臥針平刺爲主。絕無危險，且療效高。
總之，董師針刺論深淺，雖據病位、病性、體質、節令、穴位而定，但總以穴淺宜淺，穴深宜深；治遠宜深；新病宜淺，病久宜深爲要。取穴多在四肢，強調甯失之深，勿失之淺，如蚊蠅之叮咬難期收功。由於深針有透穴作用，加強了經脈間之聯系，並擴大了針刺之主治範圍，且由於一針多穴，合乎精簡原則，不但減輕進針之疼痛，又能加強刺激量，提高針刺效應，最爲董師所樂用，但不論深淺，又必以得氣爲度。
