北京中醫藥大學創建於1956年，是新中國最早成立的高等中醫院校之一，是唯一進入國家“211工程”建設的高等中醫藥院校，是國家教育部直屬的重點大學，也是由教育部、衛生部、國家中醫藥管理局共建的高等院校。

學校現設有基礎醫學院、中藥學院、針灸學院、管理學院、護理學院、人文學院、第一臨床醫學院、第二臨床醫學院、第三臨床醫學院、國際學院、繼續教育學院、遠程教育學院、台港澳中醫學部、高職部等教學機構。學校致力於構建面向新世紀的以高層次教育為主的人才培養體系，目前設有中醫學、中藥學、製藥工程、針灸推拿學、公共事業管理、工商管理、護理學、英語（醫學）、法學（醫藥衛生）9個本科專業。其中中醫學七年製含中醫科研方向、中醫臨床方向、中醫骨傷方向、中西醫結合方向、中藥方向、針灸推拿方向、針推康復方向、針推對外交流方向、醫院管理方向9個培養方向班。 截至2009年底，學校各類在校生總數為23262人，其中全日製在校生總數為10660；研究生佔全日製在校生比例為28.9%；境外學生佔全日製在校生的比例為16.6%。

學校是全國中醫藥院校中首批建立博士學科點和博士後科研流動站的單位之一，中醫學、中藥學、中西醫結合醫學3個一級學科均具有博士學位授予權，並均設有博士後科研工作流動站。 學校現有一級學科國家重點學科2個，涵蓋二級學科國家重點學科15個，另有國家中醫藥管理局重點學科21個，北京市重點學科5個，重點學科建設在全國中醫藥院校中保持領先地位。 學校現有教育部重點實驗室2個，北京市重點實驗室2個，國家中醫藥管理局重點研究室9個，國家中醫藥管理局三級（最高級）實驗室14個，是國家理科基礎科學研究和教學人才培養基地、國家生命科學與技術人才培養基地，建設有教育部中藥製藥與新藥開發關鍵技術工程中心、中醫藥現代化網上合作研究中心、中藥材規範化生產工程中心、國家大學科技園（與北京師範大學共建）。